Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC25.26■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms