Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms