Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tlr1Q9EPQ1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tlr1Q9EPQ1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tlr1Q9EPQ1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tlr1Q9EPQ1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tlr1Q9EPQ1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tlr1Q9EPQ1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tlr1Q9EPQ1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tlr1Q9EPQ1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tlr1Q9EPQ1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tlr1Q9EPQ1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tlr1Q9EPQ1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tlr1Q9EPQ1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tlr1Q9EPQ1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tlr1Q9EPQ1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tlr1Q9EPQ1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Tlr1Q9EPQ1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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