Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Xab2Q9DCD2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Xab2Q9DCD2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Xab2Q9DCD2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Xab2Q9DCD2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Xab2Q9DCD2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Xab2Q9DCD2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Xab2Q9DCD2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Xab2Q9DCD2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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