Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm17219-201ENSMUST00000168439 593 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 AC164612.2-201ENSMUST00000215737 719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 AC131120.1-201ENSMUST00000217728 1617 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms