Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc97Q9DBT3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc97Q9DBT3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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