Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ftsj3Q9DBE9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms