Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf4Q9DAW6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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