Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi35Q9D8C4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms