Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tube1Q9D6T1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms