Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms