Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms