Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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