Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtf2e1Q9D0D5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtf2e1Q9D0D5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gtf2e1Q9D0D5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gtf2e1Q9D0D5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms