Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms