Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc77Q9CZH8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc77Q9CZH8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms