Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms