Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb2bQ9CWF2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms