Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms