Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed6Q9CQG0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed6Q9CQG0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 603 ms