Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms