Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rpa3Q9CQ71 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rpa3Q9CQ71 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rpa3Q9CQ71 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rpa3Q9CQ71 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rpa3Q9CQ71 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rpa3Q9CQ71 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Rpa3Q9CQ71 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Rpa3Q9CQ71 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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