Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup155Q99P88 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms