Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NsmfQ99NF2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NsmfQ99NF2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms