Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms