Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms