Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms