Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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