Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Dnajc28Q8VCE1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Dnajc28Q8VCE1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Dnajc28Q8VCE1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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