Protein–RNA interactions for Protein: Q8K327

Champ1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Champ1Q8K327 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Champ1Q8K327 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms