Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms