Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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