Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx30Q8CE50 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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