Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc178Q8CDV0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc178Q8CDV0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc178Q8CDV0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc178Q8CDV0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc178Q8CDV0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc178Q8CDV0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc178Q8CDV0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc178Q8CDV0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc178Q8CDV0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc178Q8CDV0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc178Q8CDV0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc178Q8CDV0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc178Q8CDV0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc178Q8CDV0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc178Q8CDV0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms