Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms