Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccz1Q8C1Y8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccz1Q8C1Y8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccz1Q8C1Y8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccz1Q8C1Y8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccz1Q8C1Y8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccz1Q8C1Y8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccz1Q8C1Y8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms