Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms