Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpped1Q8BFS6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cpped1Q8BFS6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms