Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ttc28Q80XJ3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ttc28Q80XJ3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ttc28Q80XJ3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ttc28Q80XJ3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ttc28Q80XJ3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ttc28Q80XJ3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ttc28Q80XJ3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ttc28Q80XJ3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ttc28Q80XJ3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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