Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pcsk9Q80W65 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.7 ms