Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Actn1Q7TPR4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Actn1Q7TPR4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Actn1Q7TPR4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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