Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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