Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme8Q715T0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme8Q715T0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms