Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms