Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Kcnt1Q6ZPR4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Kcnt1Q6ZPR4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Kcnt1Q6ZPR4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnt1Q6ZPR4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Kcnt1Q6ZPR4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Kcnt1Q6ZPR4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Kcnt1Q6ZPR4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Kcnt1Q6ZPR4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Kcnt1Q6ZPR4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnt1Q6ZPR4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms