Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms