Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6DFW0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms