Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Atg9aQ68FE2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg9aQ68FE2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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