Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms