Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtmQ62388 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms